How do new variants arise?
A virus needs to evolve in order to evade the defences of its host.
A virus evolves, replicates and spreads, by hijacking the reproductive system of a cell (of the host organism).
It makes copies of itself, so that it can spread to other cells and other hosts.
While making copies of itself, sometimes there are mistakes- like types known as mutations.
Most of these mutations are useless for
the virus.However, sometimes a mutation makes a virus better/stronger.
One or more mutations give rise to new variants of a particular virus.
Variants of Concern (VOC) are mutated types of coronavirus, which can cause one among :
Increased transmission,
A reduction in neutralising antibodies or Severe disease.
How was the new variant detected?
The Indian-origin double mutant strain of the coronavirus-the B.1.167 was first detected on 5th October last year through genome sequencing of a virus sample.
Its genome sequencing exercise slowed down between November and January 2021, due to lack of funds.
In December 2020, the Indian SARS-CoV-2 Consortium on Genomics (INSACOG) was established.
It is a group of 10 National Laboratories.
What is the group doing?
Genomic sequencing and analysis of circulating CoVID-19 viruses, and
Correlating epidemiological trends with genomic variants.
The New Mutations & Variants
The new "mutations" détected in December 2020 were:
E484Q
LA52R
2 mutations occurred together in a
single strain - hence "double mutant".
N440K-in a separate strain.
Now, a third mutation (p614R) in the B.1.167 has been identified.
Health Ministry was **reportedly** briefed last week about the possibility of this double mutant variant developing another significant mutation, and becoming a
"triple-mutant." And three different varieties have been detected.
Two of the triple-mutant varieties have the new mutation in the spike protein.
These two versions have been found in samples collected from the second surge states -Maharashtra, Delhi, West Bengal and Chhattisgarh. A third version of the strain has the mutation outside the spike protein.This version has been observed in 17 samples, from Maharashtra, Delhi and West Bengal.
West Bengal seehs to be becoming the hotspot for such mutations.
The new triple mutant could make the virus even more capable of evading human immune response. In West Bengal, the B.1.617 strain was found in 133 out of 1373 samples.
Maharashtra = 122/1931,
Karnataka =20/539, and
Gujarat 16/859.
British labs are reporting that the South African variant (B.1.351) and Brazil variant (P.1) both have a key mutation = E484K.Helps the virus evade antibodies produced by vacines or by having had COVID-19.The Californian variant (B.1.429), discovered in December, carries the L452R mutation that makes it about 20% more infectious(transmissible).
The Indian varint has the E484Q mutation, which is very sim to the one found in the South African and Brazil variants, and also has the L452R mutation found in the Californian one.
Genome sequencing (the study of genetic structures of an organism and the changes happening therein) is crucial to understand:
the origins of the virus, the routes it has taken to reach a particular geography and the changes, or mutations, that are making the virus stronger or weaker.
The Challenges
Lack of fund allocation to the Department of Biotechnology. INSACOG suffering without funds, genome sequencing slowed down. Since INSACOG began work in February, more than 13,000 sequences have been developed from across the country. This is still not adequate.
The stated objective of INSACOG is to facilitate genome sequencing of 5% of all the emerging new cases. Over 2.5 lakh new cases are being detected every day, as of this week (18th April owards). To meet the 5%-goal, more than 12,500 samples would have to be sent for sequencing. In reality, less than 1 per cent samples are currently being sequenced.
नए संस्करण कैसे उत्पन्न होते हैं?
एक वायरस को अपने मेजबान के बचाव से बचने के लिए विकसित करने की आवश्यकता है।
एक कोशिका (मेजबान जीव के) की प्रजनन प्रणाली को अपहृत करके एक वायरस विकसित, प्रतिकृति और फैलता है।
यह खुद की प्रतियां बनाता है, ताकि यह अन्य कोशिकाओं और अन्य मेजबानों में फैल सके।
खुद की प्रतियां बनाते समय, कभी-कभी गलतियाँ होती हैं- जैसे कि टाइपो को म्यूटेशन के रूप में जाना जाता है।
इनमें से अधिकांश म्यूटेशन वायरस के लिए बेकार हैं। हालांकि, कभी-कभी एक उत्परिवर्तन एक वायरस को बेहतर / मजबूत बनाता है।
एक या अधिक उत्परिवर्तन एक विशेष वायरस के नए रूप को जन्म देते हैं।
वेरिएंट ऑफ़ कंसर्न (VOC) उत्परिवर्तित प्रकार के कोरोनावायरस हैं, जो निम्न में से एक का कारण बन सकते हैं:
संचरण में वृद्धि,
एंटीबॉडी या गंभीर बीमारी को बेअसर करने में कमी
नए संस्करण का पता कैसे लगाया गया था?
कोरोनोवायरस- B1.167 का भारतीय मूल का दोहरा उत्परिवर्ती तनाव पहली बार पिछले साल 5 अक्टूबर को वायरस के नमूने के जीनोम अनुक्रमण के माध्यम से पता चला था।
धन की कमी के कारण नवंबर और जनवरी 2021 के बीच इसकी जीनोम अनुक्रमण कि प्रक्रिया धीमा हो गया।
दिसंबर 2020 में, भारतीय SARS-COV-2 कंसोर्टियम ऑन जीनोमिक्स (इंसाकोग) की स्थापना की गई थी।
यह 10 राष्ट्रीय प्रयोगशालाओं का एक समूह है।
समूह क्या कर रहा है?
जीनोम अनुक्रमण और कोविद -19 वायरस के परिसंचारी का विश्लेषण, और जीनोमिक वेरिएंट के साथ महामारी विज्ञान के रुझान को सहसंबंधित करना
द न्यू म्यूटेशंस एंड वेरिएंट्स
दिसंबर 2020 में नए "म्यूटेशन" थे:
ई484क्यू
एलए52आर
एक साथ दो उत्परिवर्तन हुए
एकल तनाव - इसलिए "डबल उत्परिवर्ती"।
एन440के -एक अलग तनाव।
अब, B.1.167 में एक तीसरे उत्परिवर्तन (पी 614 आर) की पहचान की गई है।
स्वास्थ्य मंत्रालय ने कथित तौर पर इस डबल उत्परिवर्ती संस्करण की संभावना के बारे में पिछले सप्ताह बताया गया था, जो एक और महत्वपूर्ण उत्परिवर्तन विकसित कर रहा है, और "ट्रिपल-म्यूटेंट" बन गया है। और तीन अलग-अलग किस्मों का पता चला है।
ट्रिपल-उत्परिवर्ती किस्मों में से दो में स्पाइक प्रोटीन में नया उत्परिवर्तन होता है।
ये दो संस्करण दूसरे सर्ज राज्यों -महाराष्ट्र, दिल्ली, पश्चिम बंगाल और छत्तीसगढ़ से एकत्र किए गए नमूनों में पाए गए हैं। स्ट्रेन के तीसरे संस्करण में स्पाइक प्रोटीन के बाहर उत्परिवर्तन होता है। यह संस्करण महाराष्ट्र, दिल्ली और पश्चिम बंगाल से 17 नमूनों में देखा गया है।
पश्चिम बंगाल ऐसे परिवर्तन के लिए आकर्षण का केंद्र बनना चाहता है।
नया ट्रिपल म्यूटेंट वायरस को मानव प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया को विकसित करने में और भी अधिक सक्षम बना सकता है। पश्चिम बंगाल में, B.1.617 तनाव पाया गया
1373 नमूनों में से 133।
महाराष्ट्र = 122/1931,
कर्नाटक = 20/539, और
गुजरात 16/859,
ब्रिटिश लैब रिपोर्ट कर रहे हैं कि दक्षिण अफ्रीकी संस्करण (B.1.351) और ब्राजील संस्करण (P.1) दोनों में एक महत्वपूर्ण उत्परिवर्तन = ई484के है। हैल्प्स द्वारा निर्मित या कोविद -19.The कैलिफॉर्निया होने से उत्पन्न वायरस के एंटीबॉडी को हटा दें। दिसंबर में खोजा गया वैरिएंट (B.1.429), आई452 आरउत्परिवर्तन करता है जो इसे लगभग 20% अधिक संक्रामक (संक्रामक) बनाता है।
भारतीय संस्करण में ई484क्यू म्यूटेशन है, जो दक्षिण अफ्रीकी और ब्राजील में पाए जाने वाले वेरिएंट के लिए बहुत अधिक है, और कैलिफ़ोर्निया में भी आई452आर म्यूटेशन है।
जीनोम अनुक्रमण (एक जीव की आनुवांशिक संरचनाओं का अध्ययन और उसमें होने वाले परिवर्तन) को समझना महत्वपूर्ण है:
वायरस की उत्पत्ति, एक विशेष भूगोल और परिवर्तन, या उत्परिवर्तन तक पहुंचने के लिए इसे ले जाने वाले मार्ग, जो वायरस को मजबूत या कमजोर बना रहे हैं।
चुनौतियाँ
जैव प्रौद्योगिकी विभाग को धन आवंटन का अभाव। फंड के बिना INSACOG पीड़ित, जीनोम अनुक्रमण धीमा पड़ गया। चूंकि INSACOG ने फरवरी में काम करना शुरू किया था, इसलिए देश भर से 13,000 से अधिक अनुक्रम विकसित किए गए हैं। यह अभी भी पर्याप्त नहीं है।
INSACOG का घोषित उद्देश्य उभरते हुए सभी नए मामलों के 5% जीनोम अनुक्रमण की सुविधा प्रदान करना है। इस सप्ताह (18 अप्रैल के ) लक्ष्य के रूप में हर दिन 2.5 लाख से अधिक नए मामलों का पता लगाया जा रहा है। 5% - लक्ष्य को पूरा करने के लिए, 12,500 से अधिक नमूनों को अनुक्रमण के लिए भेजा जाना चाहिए। हकीकत में, वर्तमान में 1 प्रतिशत से कम नमूनों का अनुक्रम किया जा रहा है।
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